Linux dağıtımları Flatpak 'ı sistemlerine entegre etmekteler. Flatpak ' ı destekleyen dağıtımlar başta Pisi Linux olmak üzere sırasıyla ; Debian , Linux Mint , Ubuntu vs. Linux dağıtımlar.

Pisi Linux dağıtımında Flatpak uygulamalarını kullanmayı pratik buluyosanız , Flatpak uygulamalarını Pisi Linux uygulama deposundan bulup kurabilirsiniz. Kullanmak istediğiniz bir Flatpak uygulamasını Pisi Linux uygulama deposundan bulamazsanız ekleme isteğinde bulunabilir veya Flatpak uygulama deposundan komutları uçbirim ' e girerek kurulum işlemini tamamlayabilirsiniz.

Pisi Linux uygulama deposunda bulunan Flatseal ile, uygulama izinlerini kontrol edebilirsiniz. Izinleri kaldırırken dikkat etmeniz gerekir. Yanlışlıkla kaldıracağız sistem izinleri sisteminizin çalışmamasına neden olabilir.